SnapGene官方版(分子生物學(xué)工具)

SnapGene官方版是一款功能強(qiáng)大且專業(yè)權(quán)威的分子生物學(xué)的軟件，它模擬了Clontech的In-Fusion克隆技術(shù)，只需選擇您想要融合的DNA片段，即可設(shè)計(jì)引物，是創(chuàng)建無(wú)縫基因融合的一種非常通用的方法。軟件能夠非常直觀的注釋分析和DNA圖譜，用于創(chuàng)建和共享豐富的注釋文件，幫助我們準(zhǔn)確清晰地為分子生物學(xué)繪制相關(guān)圖形。除此之外，SnapGene界面友好，使用簡(jiǎn)單，記錄全面，融合了DNAstar和DNAman等軟件的特點(diǎn)，用戶可以直接將實(shí)驗(yàn)的每個(gè)DNA構(gòu)建體以電子格式記錄下來(lái)，輕松的幫助您完成所需要的工作。需要的朋友歡迎前來(lái)下載體驗(yàn)。

SnapGene官方版特色

1、In-Fusion 克隆
Clontech的In-Fusion克隆技術(shù)是創(chuàng)建無(wú)縫基因融合的一種非常通用的方法。SnapGene是第一個(gè)模擬此程序的軟件。只需選擇您想要融合的DNA片段，SnapGene即可設(shè)計(jì)引物。
2、GibsonAssembly
許多研究人員轉(zhuǎn)向吉布森大會(huì)，不使用限制性內(nèi)切酶將片段插入質(zhì)粒。通過(guò)PCR擴(kuò)增待連接的DNA片段以產(chǎn)生重疊末端。SnapGene簡(jiǎn)化了吉布森裝配反應(yīng)的計(jì)劃，并自動(dòng)化了底漆設(shè)計(jì)。
3、限制性克隆
SnapGene獨(dú)特的限制克隆界面以干凈的布局顯示您需要的信息。規(guī)劃克隆程序從未如此簡(jiǎn)單。如果你已經(jīng)知道你想要做什么，克隆模擬只需要幾秒鐘。如果克隆程序存在設(shè)計(jì)缺陷，則可以在模擬過(guò)程中捕獲并糾正錯(cuò)誤。
4、PCR＆誘變 
設(shè)計(jì)引物后，可用它們來(lái)模擬常規(guī)PCR，重疊延伸PCR或誘變。產(chǎn)生的DNA序列文件立即可用于進(jìn)一步操作。與限制性克隆界面一樣，針對(duì)引物的界面以直觀的方式顯示關(guān)鍵信息。
5、自動(dòng)文檔 
SnapGene最令人驚奇的地方在于它會(huì)自動(dòng)記錄克隆項(xiàng)目中的步驟。每次編輯序列或模擬克隆或PCR或誘變時(shí)，該程序都會(huì)自動(dòng)記錄在圖形歷史記錄中。在模擬DNA構(gòu)建體的創(chuàng)建之后，您可以將歷史記錄用作實(shí)驗(yàn)方案。嵌入在最終文件中的是所有的祖先構(gòu)造，其中的每一個(gè)都可以作為單獨(dú)的文件復(fù)活。

安裝教程

1、在本站下載并解壓，雙擊SnapGene.exe運(yùn)行，選擇安裝路徑，點(diǎn)擊next

2、許可協(xié)議，點(diǎn)擊i agree

3、現(xiàn)在安裝附件，用戶可以根據(jù)需求安裝；

4、安裝完成，點(diǎn)擊finish即可。

使用教程

限制性克隆的技巧
對(duì)于許多應(yīng)用，常規(guī)限制性克隆仍然是最好的方法。一些簡(jiǎn)單的技巧將有助于確保您的克隆順利進(jìn)行。
1、一般技巧
首先，在程序的每一步都要小心。從長(zhǎng)遠(yuǎn)來(lái)看，這種方法可以節(jié)省時(shí)間。
確保DNA非常干凈。當(dāng)制備載體或切除待插入的片段時(shí)，從約2μg的DNA開(kāi)始。
每次酶促反應(yīng)后，用旋轉(zhuǎn)柱純化DNA。在40-45μl的10mM Tris（pH8.5）中洗脫DNA，然后進(jìn)行下一步反應(yīng)。（在用凝膠純化DNA片段之前不需要使用旋轉(zhuǎn)柱。）
為了最大限度地提高效率，請(qǐng)盡量減少程序中的步驟數(shù)。例如，將鈍端片段克隆到鈍性載體位點(diǎn)（例如SmaI位點(diǎn)）比將其用Klenow或T4 DNA聚合酶鈍化的位點(diǎn)更好。
如有疑問(wèn)，用凝膠純化DNA片段。更清潔的起始材料將產(chǎn)生更好的結(jié)果。
2、準(zhǔn)備矢量
限制性克隆最常見(jiàn)的問(wèn)題是在手術(shù)后恢復(fù)起始載體。該問(wèn)題有兩個(gè)原因：載體的不完全消化，以及切割載體與其自身的重新連接。下面描述的技巧將最大限度地減少這些影響。
確保載體的消化完成。使用過(guò)量的限制酶（約20 U，2μgDNA），消化約4小時(shí)。如果載體需要用兩種具有不同最佳反應(yīng)緩沖液的酶切割，則依次進(jìn)行消化，并在其間進(jìn)行旋轉(zhuǎn)柱純化。
消化載體（并且如果合適的話鈍化），用磷酸酶處理：在37℃下1小時(shí)處于5'突出端，或者如果DNA具有任何平末端或3'突出端則在50℃處理1小時(shí)。
用旋轉(zhuǎn)柱除去磷酸酶。通常不需要對(duì)載體進(jìn)行凝膠純化，因?yàn)榱姿崦柑幚頃?huì)使產(chǎn)生的任何額外DNA片段失活。
3、使用載體，確保消化和磷酸酶反應(yīng)完成。徹底和反復(fù)地渦旋混合物，并且不允許任何液滴逃脫酶處理。在渦旋后短暫旋轉(zhuǎn)以確保管側(cè)沒(méi)有留下液滴是個(gè)好主意。
準(zhǔn)備插入的片段
為了制備插入的片段，不完全消化不是一個(gè)嚴(yán)重的問(wèn)題，因?yàn)槠蔚牟糠只厥帐强山邮艿?。您可以使用相?duì)較短的消化時(shí)間，對(duì)于雙重消化，您可以使用對(duì)一種或兩種酶來(lái)說(shuō)不是最理想的反應(yīng)緩沖液。
用凝膠純化插入的片段。除去除不需要的或不完全消化的DNA外，該方法還可去除酶和小分子。當(dāng)用透照儀觀察DNA條帶時(shí)，不要使用312nm或更低的短波紫外線，因?yàn)镈NA會(huì)受到嚴(yán)重?fù)p害。請(qǐng)改用360-365 nm紫外燈。
如果通過(guò)PCR產(chǎn)生插入的片段，則在進(jìn)行任何限制性消化之前用凝膠或旋轉(zhuǎn)柱純化。如果您計(jì)劃將平末端PCR片段（用聚合酶如Pfu產(chǎn)生）克隆到磷酸酶處理的載體中，請(qǐng)確保您的PCR引物含有5'-磷酸。
結(jié)扎和轉(zhuǎn)化
使用磷酸酶處理的載體，進(jìn)行對(duì)照連接，其中省略插入的片段。該對(duì)照連接應(yīng)該產(chǎn)生非常少的轉(zhuǎn)化體，因?yàn)橹挥协h(huán)狀DNA分子有效地轉(zhuǎn)化大腸桿菌，并且在不與磷酸化片段連接的情況下不能發(fā)生載體的再環(huán)化。
如果DNA僅有粘性末端，則在室溫下連接約1小時(shí)。如果DNA具有任何平端，則在室溫下連接約4小時(shí)并使用高濃度T4連接酶。
微量制作和診斷摘要
如果您使用插入的片段獲得了比用于對(duì)照連接的結(jié)扎更多的轉(zhuǎn)化體，那么您的克隆幾乎肯定會(huì)起作用，并且您通常只能制作3-4個(gè)小量制備物。
在執(zhí)行小量制備的診斷限制摘要時(shí)，始終包括起始向量作為參考標(biāo)準(zhǔn)。

軟件優(yōu)點(diǎn)

為學(xué)生，博士后和技術(shù)人員帶來(lái)的好處
工作更快，更聰明
SnapGene 使您的 DNA 操作易于可視化和模擬，并在錯(cuò)誤發(fā)生之前提醒您。
保持記錄不費(fèi)吹灰之力
SnapGene 中的每個(gè) DNA 操作都會(huì)自動(dòng)記錄，因此您可以準(zhǔn)確地看到您所做的操作并檢索祖先結(jié)構(gòu)的序列。
隨時(shí)隨地學(xué)習(xí)
如果您不熟悉克隆或特定技術(shù)，豐富直觀的 SnapGene 界面可幫助您了解其工作原理。
輕松與世界各地的同事共享數(shù)據(jù)
SnapGene 的 .dna 文件可以通過(guò)免費(fèi)的跨平臺(tái) SnapGene Viewer 打開(kāi)，使您能夠與同事共享豐富的帶注釋的地圖和序列。
PI 和實(shí)驗(yàn)室管理器的好處
更快地獲得結(jié)果
實(shí)驗(yàn)室中的人員將不再使用有缺陷的克隆程序浪費(fèi)時(shí)間，并將在第一時(shí)間開(kāi)始獲得正確的構(gòu)造。
花更少的時(shí)間教人們?nèi)绾慰寺?br /> SnapGene 是一個(gè)很好的教學(xué)工具，甚至新手克隆人也會(huì)很快學(xué)會(huì)如何自己解決問(wèn)題。